疫情结束后，畜群淘汰或全部转出畜舍要进行一次清扫和消毒，程序为：将畜粪、垫料、屋顶、墙壁各处的灰尘和蜘蛛网彻底清除，可移动的设备搬出舍，用高压水枪对畜舍内地面、地网、墙壁、通风口、屋顶进行冲洗。待畜舍内地面干燥后，用2%-3%的烧碱水或0.2%次氯酸钠喷洒消毒;此后关闭好门窗，按每立方米空间用42毫升福尔马林，进行熏蒸消毒24小时。经上述消毒后，畜舍空闲3-4周，再接新肉牛入舍。

3、妥善处理淘汰的病畜和尸体

患病的家畜随着分泌物、排泄物不断排出病原体污染环境，病死畜的尸体也是特殊传染媒介。因此，禁止将患传染病的病畜及其尸体流入市场或随意抛弃。对病死畜或淘汰病畜的尸体，应由专人用严密的容器运出，投入专用的埋尸井内深埋或焚烧。